محسن خلیلی، رئیس برکنار شده آکادمی پرسپولیس، با رد هرگونه ادعا مبنی بر دریافت پول از خانواده بازیکنان، گفت: «هر خانواده که من از آنها درخواست غیر عرف داشتم و درخواست کردم وجهی را واریز کند به حساب، سریعا مدارک را به باشگاه، مسئولان ذی‌ربط و رسانه‌ها بدهد تا ابهامات برطرف شود.»
خلیلی که پس از کنار گذاشتن حسن خان‌محمدی از سرمربیگری تیم جوانان این باشگاه، دچار حواشی شد و در نهایت از سمت ریاست آکادمی برکنار شد، درباره روند برکناری خود گفته: «من می‌گویم هرکسی هر سندی دارد و من هر درخواستی کردم، بیاید این موضوع را نشان بدهد. من برخلاف میل باطنی صحبت می‌کنم. من آدمی نیستم که وقتی از یک مجموعه بیرون می‌آیم حاشیه بسازم. سابقه نشان داده اگر حرفی نزنی و از خودت دفاع نکنی، شروع می‌کنند به اتهام. من زیاد صحبت نمی‌کنم که باشگاه محبوب و آکادمی پرسپولیس دچار حاشیه بشود. شرایط خیلی خوب است و الان دو تیم ما صدرنشین هستند، شما ببینید در گذشته وضعیت آکادمی پرسپولیس چطور بود؟»
خلیلی همچنین درباره نحوه دریافت کمک مالی گفته: «خانواده‌هایی که اگرچه انگشت شمار بودند اما دیدند ما تعمیرات انجام می‌دهیم آمدند و گفتند ما هم در این امر خیر می‌توانیم شریک باشیم. مدارک و مستندات این موارد وجود دارد و به میل خودشان بوده و هیچ درخواست وجه از سوی آکادمی نبوده و با میل شخصی برای رفاه حال بچه‌ها این اقدامات را انجام دادند.»
بازیکن پیشین پرسپولیس درباره شکایت یکی از بازیکنان به وزارت ورزش گفته: « یکی از اعضای کادرفنی تیم‌های پایه بدون اطلاع باشگاه و آکادمی از یکی از خانواده‌ها درخواست وجه کرده بود که به یکی از حساب‌ها واریز کند.
آنجا چون مسئول آکادمی من بودم، تعهد دادم و گفتم که سریعا این موضوع را پیگیری خواهم کرد. در ادامه باعث شد تا ما تغییراتی بدهیم و بعد یک سری اتفاقات رخ داد اما شیطنت‌ها ادامه‌دار بود. چندین هفته صحبت‌ها بود و می‌دیدیم که افراد می‌روند و زیرآب‌زنی می‌کنند. من گفتم اگر مدرک و دلیل نباشد اتفاقی رخ نخواهد داد اما متاسفانه این اتفاقات رخ داد و این حواشی پیرامون آکادمی باعث شد این اتفاق بیفتد.»